昨天，一条消息称“俄罗斯女性患者体内出现了18种突变病毒”，这对微博和Moments产生了打击。 许多人大喊“这太可怕了”，有些人指出，这一“爆炸性新闻”不过是媒体编译错误引起的谣言。
俄罗斯研究人员的这份报告怎么说？ 在线新闻是否正确？ 丁香园从以下角度解释了这些问题。
这个有争议的消息源于virological.org在1月4日发表的一篇论文，“淋巴瘤患者和新冠状长期淋巴瘤患者中出现Y453F和Δ69-70HV突变”。 长期COVID-19），作者是莫斯科斯科尔科沃科技学院，第一巴甫洛夫州立医科大学等单位的研究员。
患者S，女性，现年47岁，患有非霍奇金弥漫性大B细胞淋巴瘤IV期，于2020年3月27日入院接受化疗。从4月5日至4月8日，患者S接受了R-ICE方案（Rituba +异环磷酰胺+卡铂+依托泊苷）化疗。
在4月10日至4月16日之间，患者S与患者A密切接触。患者A随后被检测出新的冠状病毒呈阳性并死于新的冠状肺炎。 4月30日，患者S被检测出新的冠状病毒呈阳性，并出现了新的冠状病毒的症状。 经过至少17次连续的核酸检测超过四个月后，患者S呈阳性。 直到9月12日，测试结果才转为阴性。
研究人员比较了患者S的第一个阳性核酸和最后一个阳性核酸的采样结果，并将测序结果放入B.1.1病毒系统树中，发现患者S的病毒产生了18种特异性突变，即宿主内突变（宿主内多态性）。
同时，研究人员还对患者A的样品进行了测序。 研究人员将其基于患者S样本中的A12886G突变置于B.1.1.163谱系中。尽管该谱系主要由俄罗斯样本组成，但与患者A样本的系统发生位置不一致，这表明该病毒正在从患者A传播。在前往S患者的过程中也发生了突变。
可以看出，病人S中的病毒宿主中只有18个突变（患者S的血统携带其余18个遗传改变。），有18种突变病毒，而不是由媒体汇编的新闻。尽管已替换或删除了几个核糖核苷酸，但新的冠状病毒仍是新的冠状病毒。
图片来源：virologic.org
突变是如何发生的？
在4月10日至8月20日的132天中，患者S中的新冠状病毒具有18个突变位点，相当于1.67E-3突变/核苷酸/年，这明显高于新冠状病毒的平均进化速度。
这是淋巴瘤患者免疫功能受损的结果。 研究人员计算了每个突变位点的突变类型。 非同义和同义替换数目的估计比率为0.99，高于B.1.1中所有外部谱系的平均值（平均值= 0.57，中位数= 0.55）。 尽管差异不显着（p = 0.1）。
研究人员认为，这是因为患者的免疫功能降低，并且病毒具有宽松的选择性约束（松弛的选择性约束）和/或阳性选择的结果。
值得注意的是，患者S中的病毒同时产生了“Δ69-70HV”和“ Y453F”突变（ΔF组合）。 这种突变的组合最初是貂皮中的特定突变，后来又传给了人类。 但是，患者S没有暴露于貂皮的病史，因此研究人员认为这两个突变是在她的体内独立产生的。
除ΔF组合外，患者S还获得了另外两个突变，一个是S：Δ141-144，该突变先前曾出现在另一位免疫功能低下的患者中；另一个是S： 另一个是ORF8的翻译提前终止。
ORF8密码子27的无意义突变是突变体B.1.1.7的谱系定义突变之一，也被认为是在慢性感染的个体中产生的。 由于ORF8被认为可以抑制免疫反应，因此对于免疫功能较弱的患者，ORF8缺陷型病毒的选择可能会放宽。
图片来源：virologic.org
如何理解18个突变的含义？
尽管这项研究的结果没有互联网上公布的结果那么夸张，但病毒的突变却增加了这种流行病的不确定性。
ΔF组合可增强病毒的感染性，并可能逃避对部分中和抗体的识别，这意味着可能会挑战疫苗的有效性。幸运的是，当前的突变并未影响已开发和使用的疫苗的有效性。
Y453F突变影响病毒的受体结合域（RBD），增加与hACE2的结合，并使病毒从某些单克隆抗体和多克隆血清中具有一定程度的免疫逃逸。
其实，已有许多免疫缺陷患者慢性感染的报道（Choi B.等人，NEJM； Avanzato VA。等人，Cell等），这种情况与以前的情况相比并不特殊。
尽管仍然没有证据表明这些突变可以增加病毒的毒性，但是它们可能带来的病毒感染性和免疫逃逸的增加仍然值得我们保持警惕。
免疫力低下患者中的这些变异可能会随时传播到普通人群，从而影响病毒的传播和药物的治疗效果。这意味着在当今流行病仍在肆虐的时候，免疫缺陷性新冠状肺炎患者的基因组研究和流行病学研究应受到更多关注和深入研究。（饺子：饺子，PD。）
致谢：本文已获得中国科学院上海巴斯德研究所免疫学博士学位@最次吃糖，重庆市南安区疾病预防控制中心主任医师朱玲专业评论
【注意】
博士中国科学院上海巴斯德研究所免疫学系@第一次吃糖 审计意见：
实际上，在新冠病流行的早期，据报道许多慢性感染病例和免疫缺陷患者新冠的长期脱落。[2-3]后来，越来越多的证据表明新的冠状病毒已在宿主体内发生适应性进化。 这种适应性进化来自慢性感染，免疫缺陷和治疗过程中的选择性压力。 可以看出，在整个感染过程中的优势菌株不断变化，并且与以前的知识一致。
包括先前关于NEJM的案例 [2]，E484K和其他具有较强逃避能力的突变也已经进化，并且传染性病毒也可以在长达143天的样本中分离出来。 这也意味着长期核酸检测呈阳性的患者可能不是由于体内残留的病毒RNA。 ，它的确可能携带传染性病毒。
免疫功能低下患者也是严重的新发冠心病的危险因素之一[4]，包括感染HIV的患者，接受器官移植的患者，接受造血干细胞移植的患者以及接受化学疗法的患者等。这些人的呼吸系统并发症风险更高，并且已经被证实感染了流感病毒[5]在2009年的大流行期间，还观察到化疗期间的癌症患者和接受器官移植的患者延长了H1N1排出时间。 也有报告称MERS-CoV感染的淋巴瘤患者患有慢性感染。[6-7]。
这种情况为压力选择的突变位点提供了一定的指示，也提醒我们免疫缺陷患者应特别注意保护自己，否则一旦被感染，情况会更糟，遭受更多痛苦。
重庆市南安区疾病预防控制中心主任医师朱玲审计意见：
“俄罗斯一名妇女发现18种突变的新冠状病毒”实际上是媒体的汇编错误。 原始文本“在新的冠状病毒基因组中检测到18个突变”被错误地翻译为“在体内发现18个突变的新冠状病毒”。 突变是RNA病毒进化的基础，这意味着新的冠状病毒仍然是新的冠状病毒，而不是新的病毒，更不用说18种不同的病毒了。
标题图片的来源：创意
参考资料：
[1] https://virological.org/t/emergence-of-y453f-and-69-70hv-mutations-in-a-lymphoma- Patient-with-long-term-covid-19 / 580
[3]
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31456-2
[4] https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/need-extra-precautions/people-with-medicalconditions.html。
[5] Kunisaki KM，Janoff EN。 免疫抑制人群的流感：感染频率，发病率，死亡率和疫苗反应的综述。 柳叶刀感染病。 2009年8月； 9（8）：493-504。
[7] Kim SH。，等。 免疫功能低下宿主中MERS-CoV感染的非典型表现。 J感染化学治疗师。 2017年11月; 23（11）：769-773。
流行病动态
从1月14日19:00开始，主要更改如下：
- 广西南宁市发现1例新发冠心病肺炎
- 沉阳有8个中等风险地区
- 天津市大桥路的三份冰淇淋样品检测出新冠的阳性
……
丁香园·博士鼎翔的《流行趋势》将带您第一次了解该流行病的变化。 点击下面的卡片即可查看。
↓↓↓单击“阅读原文”以输入“流行新闻”返回搜狐查看更多